許多國家都透過法律來管理基因改造生物，在農作物方面，需要政府審查其環境風險，才允許生產，生產加工出來的食品，需要審查其健康康風險才准許上市，上市時也常需要加以標示。
相較於歐盟採用八套專法，詳細規範攸關基改生物各類活動，我國在植物品種及種苗法中訂有條文管理基改植物的種苗，在食品安全衛生管理法中，則納入基改食品的規範。
要之，在我國基改植物種苗需要中央審查通過，才得輸出入、販賣銷售。基因改造食品則規定要執行追蹤追溯制度，需通過健康風險評估審查，才能進口、加工上市，上市後也需要標示。
第一代基轉基改產品目前在我國依法管理下，可說已經上軌道，在賣場上消費者可以依意願決定購買與否。
基編基改產品也需要依法管理
不過約從2016年開始，國內開始有若干聲音，提議「基因編輯產品不應視為基因改造產品來規範」，透過研討會、座談會、演講會、以及媒體業配文等，企圖影響政府的政策。
他們的說法是，基因編輯產品如SDN1(或SDN2)，只有一兩個核鹼基的改變，自然界的變異也可能發生類似的改變，不含有外來的、新的蛋白質，因此並沒有健康風險，當然不用管理。
此外，由於SDN1產品與自然變異者沒兩樣，因此在市面上無法分辨，技術上難以檢驗出是否為基因編輯產品。
這些講法都似是而非。
基因編輯產品經過複雜的遺傳工程步驟，自然變異根本不可能發生。
前階段基因轉殖過程中，轉進去的構築體雖然號稱在研發後面階段拿掉，但不保證拿得乾淨。基因編輯會導致各類意料外變異，這已有相當多的論文加以確認。
這些都需要經過風險評估，才能夠判斷是否具風險，政府不應該放棄管理，直接讓研發者自行上市。
現行階層方式管理有漏洞
我國對基因編輯產品的管理還在討論中，不過日本等國已經通過階層審核的方式，第一階層若沒有外源基因，目標基因只有一兩個核鹼基的小改變，那就不稱為基因改造，直接過關，消費者也無從知曉。
但是基因編輯的預料外改變相當多，就算SDN1也一樣。這些改變若沒經過徹底的評估就無法得知是否有安全疑慮，因此所提的階層設計是相當不宜的。
公開登錄也須配合上市標示
另一種建議是研發者應透過全國性網路註冊系統，登錄其基因編輯產品，讓消費者得以知曉。
然而光是這樣還不夠。公開登錄是一回事，但無法取代上市標示，消費者不可能購買前先上網查登錄資料庫的。
至於基因編輯產品無法在市場上檢驗得出來的說法，已經被推翻。只要研發者在申請時提出足夠的資訊，就算只改變一個核鹼基，還是可以查出來。
再者，依照我國基改產品追蹤追溯制度，例如黃豆油、醬油等基改產品，就算無法檢測，只要有標示，還是可以管理。
因此所有基因編輯產品應該視同基因改造，上市前須經周詳的審核其風險，通過上市後也須標示為基因改造，讓消費者有決定要不要買的權利。
